Das Gemeindewappen Innerthal zeigt den Rossalpelispitz sowie den wohl bekanntesten "Wägitaler", den Zindlenspitz (auch Matterhorn des Wägitals genannt).

Zwischen diesen beiden Bergen steht die gelbe Sonne auf rotem Grund.

Der Schildfuss des Wappens in blauer Farbe stellt den Wägitalersee dar, während die beiden Berge silbern dargestellt sind.